Jde o typy F-35B a F-35C určené pro vojenské námořnictvo a námořní pěchotu.

Tyto modifikace mohou létat ve velkých výškách nadzvukovou rychlostí jen krátkou dobu, protože existuje riziko strukturálního poškození, ztráty stealth a detekce nepřítelem.

Tyto problémy byly odhaleny v roce 2011. Během letu F-35B rychlostí 1,3-1,4 Ma se stealth kryt nafoukl a F-35C utrpěla konstrukční poškození.

Podle údajů časopisu byl problém klasifikován prvním - maximálním - stupněm rizika z hlediska ohrožení plnění úkolů.

Pentagon však nepospíchá s hledáním řešení této situace.

Vedoucí programu F-35, viceadmirál Mat Winter jménem ministerstva obrany uvedl, že ministerstvo je připraveno převzít odpovědnost za rizika, ale odstraňovat  tyto nedostatky pomocí úplné výměny pokrytí všech letadel nebude, neboť problémy se objevily pouze při přetížení.

Pentagon zároveň stanovil omezení označující maximální rychlost modelů C a B 1,2 Ma.

Začátkem června portál Business Insider označil F-35 za nejhorší model amerických zbraní. Důvodem byly četné technické, výrobní vady letadla, problémy se spolehlivostí a také obrovské náklady.